臺灣-馬祖交通
立榮航空
立榮航空每日有固定航班往返松山南竿、三航班往返松山北竿，飛行時間約為50分鐘；臺中南竿航線亦有固定班次，飛行時間約65鐘。
馬祖地區氣候變化大，航班隨夏、冬季終昏時間或當日天候狀況可能會有調整，建議旅客出發前宜再洽航空公司確認。
相關資訊請洽立榮航空網站立榮航空訂票連結
聯絡電話：02-2508-6999（臺北），0836-26522（南竿），0836-56576（北竿）。
新華航業每日有固定船班往返馬祖、南竿、東引三地之間；臺馬之星每星期二停航保養。臺馬之星每日22：50於基隆出發(21:30至22:30為登輪時間)。
配合返臺維修，臺馬輪原則上雙周有一趟夜間開航返臺的航次，歡迎旅客多加運用彈性規劃遊程，詳細船班資訊請查閱新華航業股份有限公司官網:http://www.shinhwa.com.tw/，或洽客服專線:02-2425-0396。
單日(先馬後東)：基隆-南竿-東引-基隆
先開往南竿褔澳港，航程約10小時，靠港供乘客貨運上下船後，原船繼續開往東引中柱港，最後再開回基隆。
雙日(先東後馬)：基隆-東引-南竿-基隆
先開往東引中柱港，航程約8小時，靠港供乘客貨運上下船後，原船繼續開往南竿福澳港，最後再開回基隆。
臺灣->馬祖：晚上20:00購票，21:30登輪，22:50由基隆港出發，夜宿船上，航程約8~10小時。
南竿->臺灣：早上07:30購票，08:30登輪， 09:30由南竿出發，傍晚17:00至19:00間抵達基隆港。
東引->臺灣：前一天下午14:00至17:00前往老爺飯店購票，雙日11:00，單日06:00登輪，傍晚17:00至19:00間抵達基隆港。
基隆市港西街16號2樓(西岸旅客碼頭二樓大廳侯船室)。
臺灣 – 南竿航行約10小時，南竿 – 東引航行約2小時，東引 – 臺灣航程約8小時；如受機埸關閉影響，福澳港開航時間延後1個小時；如受海象、潮流、季節、濃霧等影響，臺馬之星抵港時間將有30分鐘~1小時之誤差；如風浪超過10級時將停航；建議旅客出發前宜再洽新華航業公司確認。
請參考 新華航業臺馬之星資訊網頁(相關連結) 聯絡電話：（基隆）02-2424-6868，（馬祖）0836-26655，（東引） 0836-77555。
馬祖島際交通
由南竿福澳港可搭船轉泊至各離島及大陸福州馬尾港
北竿-（白沙港）；東引-（中柱港）；東莒-（猛澳港）；西莒-（青帆港）
南、北竿交通船：
可以開航前30分鐘現場購票
南竿往北竿：07：00、09：00、10：00、11：00、13：00、15：00、16：00、17：10
北竿往南竿：07：30、09：30、10：30、11：30、13：30、15：20、16：30、17：30
南北竿、大坵航班網路訂位：馬祖海上交通訂位購票系統
．南北海運股份有限公司（吉順2、6、8、9、10號）
南竿售票處電話：0836-22193
北竿售票處電話：0836-55388
．大和航業股份有限公司（閩珠貳號、閩珠捌號）
南竿售票處電話：0836-22130
北竿售票處電話：0836-56599
．長億海運股份有限公司（金龍輪）
南竿售票處電話：0836-26169
備註：
- 購票時，請出示身分證或相關證明文件。
- 現場購票，全票160元、半票80元、縣民全票110元、團體票150元（20人以上團體）
- 免費票條件：未滿3歲之兒童、設籍連江縣年滿65歲(含)以上民眾、設籍連江縣未滿6歲之兒童、設籍連江縣身心障礙者。（請示出證件）
南竿-莒光交通船（南北之星或東海明珠）：
南竿福澳港開船時間為每週一、三、五、日 07：00、14：30 開航，每週二、四、六 07：00、11：00、14：30 開航
單月為先西後東：福澳港（45-50分鐘）->西莒（15分鐘）->東莒 （45-50分鐘）->福澳港
雙月為先東後西：福澳港（45-50分鐘）->東莒（15分鐘）->西莒 （45-50分鐘）->福澳港
現場購票，票價：全票250元，半票125元、縣民全票200元、縣民半票100元
網路訂位：馬祖海上交通訂位購票系統
備註：
- 開放兩個月內電話訂位。
- 3歲以下、65歲以上及身心障礙者得享有半票優待。
- 免費票條件：未滿3歲之兒童、設籍莒光之鄉親、設籍連江縣年滿65歲(含)以上民眾、設籍連江縣未滿6歲之兒童、設籍連江縣身心障礙者、莒光鄉通勤之公教公務人員。（請示出證件）
南北海運股份有限公司 ：0836-22193 （南北之星+東海明珠）
東西莒交通船（莒光之星）：
西莒往東莒：07：30、10：00、14：00、17：10
東莒往西莒：07：40、10：10、14：10、17：20
現場購票：全票80元、半票40元
備註： 3歲以下、65歲以上及身心障礙者得享有半票優待。
莒光海運行 ：0836-89121（莒光之星）
南竿-東引交通船（臺馬之星）：
配合臺馬之星航班，南竿前往東引，上午9點10分以前在福澳候船大樓購票登船（周三無航班）；東引前往南竿，搭船前一日在新華公司服務處購票。全票350元、半票175元。
新華航業： 0836-26655（南竿）， 0836-77555（東引）
南竿-東引交通船（臺馬輪、東海明珠）：
臺馬輪延用，每單日從南竿開往東引，上午8點30分開航，乘客請前往碼頭現場購票。東引前往南竿，上午7點開航，搭船前一日晚上在新華公司服務處購票。全票350元、半票175元。
若臺馬交通停航，將會由東海明珠代開，請留意本站航班公告。
大坵交通船：
南竿-大坵交通船（福澳港出發）：
3、4、5月（每日1班次）：
今年3月20日起開航
去程：09:20福澳港→大坵、回程：12:00大坵 → 12:10白沙港 → 12:30福澳港
6、7、8月（每日2班次：
第1班去程：09:20福澳港 → 大坵；回程：12:00大坵 → 12:10白沙港 → 12:30福澳港
第2班去程：13:20福澳港 → 大坵；回程：15:40大坵 → 16:00白沙港 → 16:15福澳港
9、10月（每日1班次）：
去程：09:20福澳港→大坵、回程：12:10大坵→白沙港→福澳港
大坵航班歡迎使用線上訂位系統：馬祖海上交通訂位購票系統
來回票：
全票：350元
縣民票：230元
優惠票：175元（滿3歲而未滿12歲之兒童、65歲以上及身心障礙者）
保險票：35元（3歲以下）
航行限制：未達7人不開航，陣風9級時停航、8級視海象決定。
預約電話：0836-23406 / 0836-22130 傳真：0836-23593
0836-22193 / 0836-25151 傳真：0836-23999
北竿-大坵交通船（橋仔港出發）：
鄉公所提供的定期航班：每天3班次（4月23日至10月15日）
第1班：08:30橋仔港 → 大坵 / 10:30大坵 → 橋仔港
第2班：09:30橋仔港 → 大坵 / 11:30大坵 → 橋仔港
第3班：14:30橋仔港 → 大坵 / 16:30大坵 → 橋仔港
小船業者提供的不定期航班：只需兩人以上就開航，遊客登島1小時30分之後返航。
大坵2號0937-896835（兩人就開航）、崴盛號：0981-373840、梅花公主號0965-649046
來回票：
全票：300元
北竿鄉民：200元
離島直昇機：
海上交通中斷時啓動。南竿往返東引、莒光每日最多3架次，第4架次以上需向交旅局申請核可。
南竿–東引：
航班時刻：
1.每日僅一航班者：
10:40南竿起飛~~~11:20南竿落地
2.每日兩航班者：
第一航班09:20南竿起飛~~~10:00南竿落地
第二航班10:40南竿起飛~~~11:20南竿落地
每架次最少需有設籍當地居民4人始可飛航，當日不足飛航人數時，則併入隔日飛行。
訂位時間：每日08:00~17:30
東引票價：設籍馬祖民眾1200元、非設籍馬祖民眾3000元
莒光票價：設籍馬祖民眾800元、非設籍馬祖民眾2000元。
（2歲以下免費、65歲以上及身心障礙者半票優待）
連江縣港務處官網：
http://www.mtha.gov.tw/FlightInfo/MonthInfo.aspx